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我國科研團隊創(chuàng)新空間蛋白質(zhì)組學(xué):PLATO技術(shù)引領(lǐng)生命科學(xué)研究新篇章

   發(fā)布時間:2025-02-06 20:02 作者:沈瑾瑜

近日,中國科學(xué)院動物研究所趙方慶團隊在權(quán)威科學(xué)期刊《Cell》上發(fā)表了一項突破性研究成果。該團隊開發(fā)了一種名為PLATO的全新空間蛋白組學(xué)技術(shù)框架,為復(fù)雜組織的蛋白質(zhì)空間分布研究開辟了新路徑。

PLATO技術(shù)融合了人工智能深度學(xué)習(xí)算法與微流控技術(shù),實現(xiàn)了前所未有的全組織切片水平高分辨率空間蛋白質(zhì)組檢測。據(jù)了解,該技術(shù)能夠達到25微米的分辨率,并能同時檢測數(shù)千種蛋白質(zhì),這一成就突破了高通量原位組學(xué)技術(shù)的傳統(tǒng)瓶頸。

傳統(tǒng)的空間蛋白質(zhì)組方法主要依賴于抗體染色或質(zhì)譜技術(shù)。然而,抗體染色方法受限于靶標數(shù)量,通常只能檢測幾十至幾百種蛋白分子;而質(zhì)譜技術(shù)雖然檢測種類豐富,但其逐點取樣的方式卻大大增加了實驗成本和規(guī)模。PLATO技術(shù)的出現(xiàn),則有效解決了這些問題。

PLATO技術(shù)從斷層掃描成像的重構(gòu)原理中汲取靈感,通過降維后的平行流投影與深度學(xué)習(xí)算法Flow2Spatial的結(jié)合,成功重構(gòu)出蛋白質(zhì)的高分辨率空間分布。Flow2Spatial算法運用自編碼器模型,將平行流投影的實驗過程模擬為“降維編碼”,并通過整合組織學(xué)染色、空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)等其他空間組學(xué)數(shù)據(jù),對蛋白質(zhì)空間分布進行高精度“升維解碼”。

這一原創(chuàng)算法的突破,不僅克服了傳統(tǒng)技術(shù)難以獲取空間信息的限制,還顯著提高了空間蛋白質(zhì)組的覆蓋度和分辨率。PLATO技術(shù)的成功應(yīng)用,為解析其他組學(xué)分子的空間分布提供了全新的解決方案,有望推動生命科學(xué)研究領(lǐng)域的深入發(fā)展。

值得注意的是,PLATO技術(shù)深度融合了人工智能算法、微流控和質(zhì)譜技術(shù),展現(xiàn)了跨學(xué)科合作的強大力量。隨著技術(shù)的不斷迭代和創(chuàng)新,PLATO有望成為生命科學(xué)研究領(lǐng)域的重要工具,為科研人員提供更多、更精準的實驗數(shù)據(jù)和分析手段。

 
 
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